Los valores de frontera son los valores de las variables meteorológicas en los bordes de la región en la cual se hace la simulación. Estos valores se suponen conocidos y los mismos restringen las variables en cualquier localidad especifica. Por ejemplo, sabemos que la velocidad del viento disminuye a medida que nos acercamos al suelo, y se anula en la superficie. La velocidad cero en el suelo es una condición de borde o frontera en la ecuación diferencial que involucra al viento.
Las restricciones externas son condiciones que se imponen sobre el dominio de integración (en nuestro caso, la atmósfera). Por ejemplo, la radiación solar se impone desde el tope de la atmósfera y rige el rango de posibles valores de la temperatura para el clima. Un valor mas bajo (que los actuales) de radiación solar podría crear una edad de hielo climática. La cantidad de gases de invernadero es también considerada como condicionante o restricción externa. El albedo o reflectividad de la superficie es también una restricción externa (a menos que se produzcan cambios debidos a un cambio climático, como un aumento de la superficie cubierta de hielo, debido a los efectos de una duplicación del contenido de anhídrido carbónico en la atmósfera).
Un aumento o disminución del numero de clavijas en la matriz del flipper, es análogo a cambiar las condiciones de borde o condicionantes externos. Para eliminar una clavija, simplemente desplazamos el cursor hacia una clavija en particular usando el ratón y presionamos el botón izquierdo del mismo. Similarmente desplazando el cursor hacia un espacio libre y accionando el ratón, agregamos aleatoriamente una clavija en la matriz. Esto nos permite crear una cerca o alternativamente un agujero en la matriz que condicionara el movimiento de las bolas.